潔凈棚與普通廠房的主要區別在于凈化程度和造價。潔凈棚采用工業鋁材或不銹鋼方通等材料作為框架，配備風機濾網機組（FFU）送風，并懸掛防靜電垂簾，內部凈化級別可達100-100000級。而普通廠房則不具備這樣的凈化系統，與外部環境無區別。潔凈廠房的造價較高，因為它包含特殊的排風系統、過濾系統和智能化系統。